发酵床完全可以运用于养牛，这与过去在牛圈中垫草料是完全不同的，因为草料不能分解粪便，只能起到保暖和吸收粪尿的作用，而发酵床则完全可以分解牛粪和吸收挥发牛尿。
使用年限的长短与材料的选择、管理、养殖密度有较大的关系，例如采用锯末制作垫料为例，惰性较高的野杂木锯末不容易被分解，使用年限会长些，相反惰性较低的杉木等使用年限会稍短；使用中养殖密度过大，会造成垫料负荷过重，也会造成垫料的寿命缩短；养殖中管理不好，造成经常被水浸泡垫料，或者加入了泥土腐土等，让野生杂菌（土着菌）进入垫料层中，也会造成板结严重、加速分解垫料，造成垫料使用寿命缩短。一般来说，采用杂木制作的垫料在正常的管理下可以使用4年左右。
首先要选择木质化程度较高的惰性材料，只要没有毒的任何树木的锯末、谷壳粉均可使用，锯末缺乏的地方，可以购买杂木进行粉碎，市场上有专门的木头粉碎机销售，粉碎时可以采用3-5毫米的筛子，整个垫料层可以全部采用锯末，但不可以全部采用谷壳，如果当地谷壳资源多，在上层20厘米谷壳的数量不要超过50%，也就是说上层的20厘米可以选择锯末与谷壳各50%混匀。
30厘米的下层，可以全部是谷壳、锯末，也可以使用秸秆，例如玉米秸秆、甘蔗渣、树木、竹子木屑、花生壳等，但不能使用稻草，稻草是不能使用到发酵床上的，因为稻草容易板结和腐烂。
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