黄鳝性成熟，繁殖季节为5～8月份。繁殖盛期是6～7月份。繁殖之前，亲鳝先钻洞，称为繁殖洞。繁殖洞与居住洞有所不同，繁殖洞一般在埂边，洞口通常开在埂边隐蔽处，洞口下缘没在水中。繁殖洞分前洞和后洞2种，前洞产卵用，后洞较细长，洞口进去约10厘米处比较宽阔，洞的上下距离约5厘米，左右距离约10厘米。
产卵前雌雄鳝吐泡沫筑巢，然后雌鳝将卵产于巢上，雄鳝在卵上排精，卵在泡沫上受精孵化发育，这样可大大提高受精率和孵化率。这是因为：
①泡沫能保护受精卵，使之不易被敌害发现；
②可提高受精率，因精子在水中的寿命极短，而在泡沫巢中的寿命较长，这就为提高受精率提供了条件；③使受精卵浮在水面，水面一般含溶解氧较多，水温也高，而且还可以直接从空气中得到氧气，有利于提高孵化率。
雄鳝有护卵习性，在天然水域中雄鳝在泡沫巢上排精后，就一直守护到仔鳝出膜并等仔鳝的卵黄囊消失、能自由游泳摄食为止。在此期间，即使雄鳝受到惊动也不远离，甚至还会奋起攻击来犯者。雌鳝一般在产卵后就离开繁殖洞。
黄鳝胚胎发育的最适温度是21℃～28℃，从受精卵到孵出仔鳝，一般在水温30℃左右时需5～7天，最长时间达9～11天。孵化时要求水温稳定，自然界中的黄鳝受精率和孵化率可达到95％。
胚胎发育过程中，黄鳝具有不同于其他鱼类的特点：
①胚胎发育时间长，一般需5～11天；
②出膜时间不一，先后相差约48小时；
③出膜仔鳝个体大，对环境耐受力强，在室内玻璃缸里的仔鳝，不摄食也能存活2个月之久；
④胸鳍在胚胎期形成后，不断地扇动，出膜后逐渐退化。
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