临床症状：患病的小尾寒羊体温升高，精神不振，食欲低下，常于口腔黏膜、蹄部皮肤上形成水疱、溃疡和糜烂，有时病害也见于乳房部位。口腔损害常在唇内面、齿龈、舌面及颊部黏膜发生水疱和糜烂，疼痛流涎，涎水呈泡沫状。如单纯口腔发病，一般１～２周可望痊愈；当累及蹄部或乳房时，则２～３周方能痊愈。一般呈良性经过，死亡率不过１％～２％。小尾寒羊羔羊发病则常表现为恶性口蹄疫，发生心肌炎，有时呈出血性胃肠炎而死亡，死亡率可达２０％～５０％。
病理变化：病死羊除见口腔、蹄部和乳房部等处出现水疱、烂斑外，严重病例咽喉、气管、支气管和前胃黏膜有时也有烂斑和溃疡形成。前胃和肠道黏膜可见出血性炎症。心包膜有散性出血点。心肌松软，似煮熟状；心肌切面呈现灰白色或淡黄色的斑点或条纹，好似老虎身上的斑纹，称为“虎斑心”。
实验诊断主要包括病原学检查和血清学检查两种方法。
病原学检查：一是病样采集。通常采集新鲜的水疱皮或水疱液，采后加入等量 PH７.６含１０％胎牛血清的组织培养液；也可从刚发过病的动物身上采集病料，一般采集血液（注意加抗凝剂）、血清或用食道探杯刮取喉部一食道分泌物；死亡动物则可采集淋巴结、甲状腺或心肌等材料作为病料，采集的样品应在冰冻状态下迅速送达专门实验室进行检验。也可将采集的样品，置于 PH７.６含５０％甘油的０.０４摩尔／升磷酸盐缓冲液中，用装有冷却剂的保温瓶送往实验室。二是电镜观察。口蹄疫病毒粒子大致呈圆形或六角形，衣壳呈二十面立体，无囊膜。取病料作超薄切片，在电镜下可见到胞浆内呈晶格状排列的口蹄疫病毒。三是组织培养。口蹄疫病毒可在牛舌上皮细胞、牛肾细胞、猪肾细胞、豚鼠肾细胞、仓鼠肾细胞和兔肾细胞等原代细胞以及猪肾细胞、乳仓鼠肾细胞等继代细胞中增殖。四是动物接种试验。将采集的水疱皮置于平皿内，用灭菌的 PH７.６磷酸盐缓冲溶液冲洗４～５次，于灭菌乳钵中剪碎，加入适量灭菌石英砂研磨，用 PH７.６磷酸盐缓冲液制成１∶５～１∶１剂，每毫升加入青霉素１０００国际单位、链霉素１０００微克，置２～４℃冰箱浸毒４～６小时，以３０００转／分离心１０～１５分钟，取上清液备用。抗凝血液可直接作接种用。选用２～７日龄乳小鼠１０只，于颈背部皮下接种病毒感染液０.２毫升。一般接种小鼠于２０～３０小时出现典型的口蹄疫症状。发病乳小鼠运动不灵活，用镊子夹尾巴和四肢，常可发现其已失去知觉。随后四肢麻痹，呼吸急促，终死亡。采集濒死期或新死乳小鼠的骨骼肌，研磨制成１０％的病料悬液，供传代接种和鉴定用。也可和豚鼠或乳兔进行试验接种。
血清学试验：血清学试验常用于口蹄疫毒毒型的鉴定，以便依据流行毒株的血清型选用同型口蹄疫疫苗，进行紧急免疫接种。常用的血清学试验有补体结合反应、中和试验、琼脂扩散试验等。近年来国内外报道了检测口蹄疫病毒的核酸探针技术，可更为快速、简便地诊断口蹄疫。
羊口蹄疫应与蓝舌病等类似疾病进行区别。口蹄疫是一种高度接触性传染病，而蓝舌病则主要通过库蠓的叮咬传播。口蹄疫牛、猪易感性高，均可感染发病；而蓝舌病在牛发病较少，猪一般不感染。口蹄疫的糜烂病灶是因水疱破溃而发生，而蓝舌病的溃疡不是由于水疱破溃后所形成，缺乏水疱破裂后那样的不规则边缘。通过血清学试验可区分口蹄疫病毒和蓝舌病病毒。
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