病畜是危险的传染源。在症状出现前，从病畜体内开始排大量病毒，发病初期排毒量多。病毒随分泌物和排泄物排出。水疱液、水疱皮、奶、尿、唾液及类便含毒量多，毒力也强，富于传染性。牧区的病羊由于患病期症状轻微，易被忽略，因此，羊群可成为长期的传染源。猪感染后的排毒量约为牛的一百至两千倍，因此认为猪对本病的传播起着相当重要的作用。隐性带毒者主要为牛、羊及野生偶蹄动物，猪不能长期带毒。一般认为疫苗毒株的散毒和变异是引起口蹄疫暴发的主要根源。

感染口蹄疫的人也可常带毒和散毒。畜产品（皮毛、肉品、奶制品）、饲料、草场、饮水和水源交通运输工具、饲养管理用具，一旦被病毒污染，均可成为传染源。有人认为候鸟带毒是某些偏远地区多年不发生口蹄疫后突然暴发的原因，但此说尚未获得充足的证据。