为了提纯水蚯蚓，可将一桶蚓团先倒入方形滤布中在水中淘洗，除去大部分泥沙，再倒入大盆摊平，使其厚度不超过10厘米，表面铺一块罗纹纱布淹水1.5～2厘米深，用盆盖盖严，密封约2小时后（气温超过28℃时，密闭的间要缩短，否则会闷死水蚯蚓），水蚯蚓会从纱布眼里钻上来，揭开盆盖，提起纱布四角，即能得到与渣滓完全分离的干净水蚯蚓。此法可重复1～2次。将渣滓里的水蚯蚓再提些出来，盆底剩下的残渣含有大量的卵茧和少许蚓体，应倒回养殖池。