鲁西黄牛消毒的意图是消除传染源散播于外界环境中的病原微生物，堵截传达路径，阻止疫病持续蔓延。鲁西黄牛应建立切实可行的消毒准则，定时对羊舍地上土壤、粪便、污水、皮裘等进行消毒。

进场

鲁西黄牛应设有消毒室，室内两边、顶壁设紫外线灯，地上设消毒池，用麻袋片或草垫浸4％氢氧化钠溶液，进场人员要更换鞋，穿专用工作服，做好挂号。

场大门设消毒池，常常喷4％氢氧化钠溶液或3%过氧乙酸等。消毒办法是将消毒液盛于喷雾器，喷洒天花板、墙面、地上，然后再开门窗通风，用清水冲洗饲 槽、用具，将消毒药味除掉。如羊舍有密闭条件，舍内无羊时，可关闭门窗，用福尔马林熏蒸消毒12小时~24小时，然后开窗通风24小时，福尔马林的用量为 每立方米空间25毫升~50毫升，加等量水，加热蒸腾。通常情况下，羊舍消毒每周1次，每年再进行2次大消毒。产房的消毒，在产羔前进行1次，产羔顶峰时 进行屡次，产羔结束后再进行1次。在病羊舍、阻隔舍的出入口处应放置浸有4％氢氧化钠溶液的麻袋片或草垫，避免病原分散。

羊舍

羊舍除坚持干燥、通风、冬暖、夏凉以外，平时还应做好消毒。通常分两个过程进行：步先进行机械打扫；第二步用消毒液。羊舍及运动场应每周消毒一次，全部羊舍用2%－4%氢氧化钠消毒或用1∶1800~3000的百毒杀带羊消毒。

地上

土壤外表可用10％漂白粉溶液，4%福尔马林或10%氢氧化钠溶液。停放过芽孢杆菌所造成的传染病（如炭疽）病羊尸身的场所，应严厉加以消毒。首要用上述漂白粉溶液喷洒地上，然后将表层土壤掘起30厘米左右，撒上干漂白粉与土混合，将此表土妥善运出埋葬。

污水

常用的办法是将污水引入处置池，参加化学药品（如漂白粉或其他氯制剂）进行消毒，用量视污水量而定，通常1升污水用2克~5克漂白粉。

粪便

羊的粪便消毒办法有多种，实用的办法是生物热消毒法，即在距鲁西黄牛100米~200米以外的当地设一堆粪场，将羊粪堆积起来，喷少数水，上面覆盖湿泥封严，堆积发酵30天以上，即可作肥料。