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蛋鸡嗉囊有水可能是患有新城疫导致的。新城疫一般表现为呼吸困难、下痢、排黄白色或黄绿色粪便、嗉囊胀大、嗉囊积水，病程长的出现神经症状，一般多是鸡发病，鸭、鹅发病较少。可以给蛋鸡接种新城疫疫苗，能有效治疗新城疫。